Ang Genotyping ug Phenotyping Makaila, ug gani Magatagna, ang Pagtambal sa Drug sa HIV
Bisan alang sa mga tawo nga adunay igong gidaghanon sa pagtambal sa therapy, ang pipila nga matang sa resistensya sa droga sa HIV gilauman nga molambo sa paglabay sa panahon tungod sa natural nga mutasyon sa virus. Sa ubang mga kaso, ang pagsupak kusog nga molambo sa dihang ang suboptimal adherence nagtugot sa resistant nga mga populasyon sa HIV nga molambo, nga magdala sa katapusan sa pagtambal nga kapakyasan.
Kung mahitabo ang kapakyasan sa pagtambal, ang mga alternatibong tambal nga kombinasyon kinahanglan nga mapili aron mapugngan kining bag-ong populasyon nga resistant virus.
Ang pag-eksamin sa genetic resistance makatabang sa pagpahigayon niini pinaagi sa pag-ila sa matang sa resistensya nga mutation sa "viral pool" sa usa ka tawo, samtang nagtino kung unsa ka delikado ang mga virus nga posible nga mahimong mga antiretroviral agent .
Duha ka nag-unang gamit ang gigamit alang sa genetic resistance testing sa HIV: ang HIV genotypic assay ug HIV phenotypic assay .
Unsa ang usa ka Genotype ug Phenotype?
Sa kahulugan, ang usa ka genotype mao lamang ang genetic makeup sa usa ka organismo, samtang usa ka phenotype ang makita nga mga kinaiya o mga kinaiya sa maong organismo.
Ang genotypic assay (o genotyping) function pinaagi sa pag-ila sa napanunod nga mga instruksyon sulod sa genetic coding sa cell, o DNA. Ang phenotypic assays (o phenotyping) nagpamatuod sa pagpahayag sa maong mga instruksyon ubos sa impluwensya sa nagkalainlain nga kahimtang sa kinaiyahan.
Bisan tuod ang pagkadugtong tali sa genotype ug phenotype dili hingpit, ang genotyping kasagaran mao ang predictive sa phenotype, ilabi na kon ang mga kausaban sa genetic nga code naghatag sa gipaabot nga mga pagbag-o sa mga kinaiya o mga kinaiya-sama sa pagpalambo sa resistensya sa droga.
Sa laing bahin, ang Phenotyping nagpamatuod sa "karon ug sa karon." Kini nagtumong sa pagsusi sa reaksyon sa organismo sa mga piho nga pagbag-o sa presyur sa kalikopan-sama sa dihang ang HIV na-expose sa lainlaing mga tambal ug / o tambal nga konsentrasyon.
Pagpatin-aw sa HIV Genotyping
Ang genotyping sa HIV kasagaran ang labing komon nga teknolohiya nga gigamit alang sa pagbuntog sa pagsulay.
Ang tumong sa pagsulay mao ang pag-ila sa piho nga genetic mutation sa gag-pol nga rehiyon sa genome (genetic code) sa virus. Kini ang rehiyon diin ang mga reverse transcriptase, protease ug integrase nga mga enzyme-ang mga target sa kadaghanan sa mga antiretroviral nga mga droga -nga gi-encode sa kadena sa DNA.
Pinaagi sa una nga pagpadako sa genome sa HIV gamit ang polymerase chain reaction (PCR) nga teknolohiya, ang mga technician sa laboratoryo mahimong mosunod (o "mapa") ang genetics sa virus gamit ang nagkalain-laing teknolohiya sa detection sa mutation.
Ang mga mutation sa tesis (o pagtipon sa mutasyon) gihubad sa mga teknisyan nga nag-analisar sa relasyon tali sa giila nga mga mutasyon ug ang gilauman nga pagkadaling mahitabo sa lainlaing antiretroviral drugs. Ang mga datos sa online makatabang pinaagi sa pagtandi sa pagkasunod-sunod sa test sa usa ka prototype nga "wild-type" nga virus (ie, HIV nga adunay dili mutubag nga resistensya).
Ang paghubad niini nga mga pagsulay gigamit aron mahibal-an ang pagkamabug-at sa droga, nga adunay mas daghang gidaghanon nga mga mutasyon nga gitugyan ngadto sa mas taas nga ang-ang sa resistensya sa droga .
Pagpatin-aw sa HIV Phenoytyping
Ang HIV phenotyping nag-usisa sa pagtubo sa HIV sa tawo sa presensya sa usa ka droga, unya gitandi nga ang pagtubo sa usa ka kontrol, ihalas nga tipo nga virus sa samang droga.
Sama sa genotypic assay, ang mga eksamin sa phenotypic nagpadako sa gag-pol rehiyon sa HIV genome.
Kini nga seksyon sa genetic nga kodigo dayon "gisumbak" ngadto sa usa ka klase nga clone gamit ang recombinant DNA technology . Ang resulta nga recombinant virus gigamit sa pagtakod sa mga selula sa mammalian sa vitro (sa lab).
Ang viral nga sample dayon mabutyag sa nagkadaghang konsentrasyon sa nagkalain-laing antiretroviral drugs hangtud nga 50% ug 90% ang nakakuha sa viral suppression. Ang mga konsentrasyon gitandi sa mga resulta gikan sa kontrol, ihalas nga klase nga sample.
Ang mga kausaban sa paryente nga "fold" naghatag sa gidak-on sa bili diin ang pagkadaling masabtan sa droga natino. Ang upat ka pilo nga pagbag-o nagpasabut nga upat ka beses ang gikinahanglan nga kantidad sa droga aron makab-ot ang viral suppression kumpara sa ihalas nga matang.
Kon mas dako ang bili, ang dili kaayo delikado nga virus mao ang usa ka piho nga tambal.
Kining maong mga prinsipyo gibutang sa ubos sa clinical ug upper-clinical ranges, nga adunay taas nga mga bili nga nagtugot sa mas taas nga lebel sa resistensya sa droga. (Tan-awa ang sample report .)
Kanus-a Gihimo ang Pagsusi sa Genetic Resistance?
Sa US, ang pagtesting sa genetic resistance sa tradisyonal nga paagi gipahigayon sa pagtambal nga naïve nga mga pasyente aron pagtino kon aduna ba sila'y "nakuha" nga resistensya sa droga. Ang mga pagtuon sa US nagsugyot nga sa taliwala sa 6% ug 16% sa gipasa nga virus mahimo nga makasugakod sa dili mokubos sa usa ka antiretroviral drug, samtang dul-an sa 5% ang makasugakod sa labaw sa usa ka klase sa droga.
Ang pagsulay sa paglungtad sa genetiko gigamit usab kung ang gidaghanon sa mga drug suspect nga gidudahan sa mga indibidwal sa therapy. Ang pagsulay gihimo samtang ang pasyente nag-antos sa dili maayo nga rehimen o sulod sa upat ka semana sa paghunong sa pagtambal kon ang viral load labaw pa kay sa 500 ka kopya / mL. Ang pag-eksamin sa genotypic sa kasagaran gipalabi niini nga mga higayon samtang kini nagkunhod, mas dali nga panahon sa pagpabalik, ug naghatag og dugang nga pagkasensitibo sa pag-ila sa mga panagsama sa ihalas nga matang ug resistant nga virus.
Ang usa ka kombinasyon sa phenotypic ug genotypic testing sa kasagaran gipalabi alang sa mga tawo nga adunay komplikado, daghan nga drug resistance, ilabi na alang sa mga naladlad sa protease inhibitors .
Mga Tinubdan:
World Health Organization (WHO). "Kamatuoran sa HIV nga Pagdepensa sa HIV." Geneva, Switzerland; Abril 11, 2011.
Kim, D .; Ziebell, R .; Saduvala, N .; ug uban pa. "Trend sa transmitted HIV-1 ARV drug resistance-associated mutation: 10 nga mga lugar sa surveillance sa HIV, US, 2007-2010." Ika-20 nga komperensya mahitungod sa Retroviruses ug Opportunistic Infections. Atlanta, Georgia; Marso 6, 2013; Oral abstract 149.
National Institutes of Health (NIH). "Mga Sumbanan sa Paggamit sa Antiretroviral nga mga Ahente sa mga Hingkod ug mga Tin-edyer sa mga HIV-1." Bethesda, Maryland; Oktubre 11, 2013.